Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTLA4P16410 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTLA4P16410 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms