Protein–RNA interactions for Protein: P16389

KCNA2, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA2P16389 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA2P16389 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA2P16389 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA2P16389 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA2P16389 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms