Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFXP16104 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFXP16104 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms