Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA2P15927 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA2P15927 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA2P15927 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA2P15927 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA2P15927 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA2P15927 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA2P15927 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA2P15927 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA2P15927 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA2P15927 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA2P15927 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA2P15927 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA2P15927 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA2P15927 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA2P15927 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA2P15927 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA2P15927 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA2P15927 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA2P15927 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA2P15927 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA2P15927 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA2P15927 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA2P15927 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA2P15927 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA2P15927 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA2P15927 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA2P15927 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA2P15927 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA2P15927 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA2P15927 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA2P15927 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA2P15927 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA2P15927 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms