Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAG1P15918 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAG1P15918 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAG1P15918 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAG1P15918 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAG1P15918 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAG1P15918 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAG1P15918 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAG1P15918 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG1P15918 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAG1P15918 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAG1P15918 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAG1P15918 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAG1P15918 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAG1P15918 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAG1P15918 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAG1P15918 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAG1P15918 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAG1P15918 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG1P15918 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG1P15918 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG1P15918 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG1P15918 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG1P15918 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG1P15918 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAG1P15918 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAG1P15918 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAG1P15918 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAG1P15918 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAG1P15918 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAG1P15918 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAG1P15918 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAG1P15918 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAG1P15918 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAG1P15918 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAG1P15918 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAG1P15918 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAG1P15918 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAG1P15918 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAG1P15918 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAG1P15918 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAG1P15918 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAG1P15918 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAG1P15918 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAG1P15918 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAG1P15918 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAG1P15918 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAG1P15918 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAG1P15918 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAG1P15918 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAG1P15918 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms