Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF4P15884 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF4P15884 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF4P15884 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF4P15884 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF4P15884 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF4P15884 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF4P15884 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF4P15884 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF4P15884 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF4P15884 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF4P15884 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF4P15884 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF4P15884 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF4P15884 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF4P15884 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF4P15884 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF4P15884 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF4P15884 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF4P15884 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF4P15884 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF4P15884 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF4P15884 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF4P15884 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF4P15884 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF4P15884 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF4P15884 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF4P15884 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF4P15884 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF4P15884 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF4P15884 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF4P15884 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF4P15884 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF4P15884 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF4P15884 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF4P15884 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF4P15884 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF4P15884 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF4P15884 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF4P15884 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF4P15884 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF4P15884 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF4P15884 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF4P15884 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF4P15884 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF4P15884 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF4P15884 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF4P15884 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF4P15884 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF4P15884 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF4P15884 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCF4P15884 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF4P15884 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF4P15884 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF4P15884 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF4P15884 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF4P15884 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF4P15884 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF4P15884 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF4P15884 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF4P15884 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF4P15884 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF4P15884 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF4P15884 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF4P15884 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF4P15884 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF4P15884 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF4P15884 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF4P15884 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF4P15884 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF4P15884 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF4P15884 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF4P15884 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF4P15884 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF4P15884 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF4P15884 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF4P15884 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF4P15884 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF4P15884 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF4P15884 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF4P15884 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF4P15884 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF4P15884 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms