Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD46P15529 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD46P15529 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD46P15529 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD46P15529 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD46P15529 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD46P15529 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD46P15529 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD46P15529 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD46P15529 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD46P15529 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD46P15529 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD46P15529 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD46P15529 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD46P15529 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD46P15529 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD46P15529 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD46P15529 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD46P15529 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD46P15529 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD46P15529 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD46P15529 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD46P15529 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD46P15529 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD46P15529 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD46P15529 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD46P15529 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD46P15529 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD46P15529 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD46P15529 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD46P15529 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD46P15529 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD46P15529 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD46P15529 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD46P15529 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD46P15529 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD46P15529 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD46P15529 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD46P15529 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD46P15529 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD46P15529 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD46P15529 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD46P15529 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD46P15529 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD46P15529 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms