Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFAPP14136 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFAPP14136 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFAPP14136 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFAPP14136 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFAPP14136 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFAPP14136 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFAPP14136 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFAPP14136 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFAPP14136 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFAPP14136 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFAPP14136 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFAPP14136 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFAPP14136 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFAPP14136 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFAPP14136 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GFAPP14136 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFAPP14136 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFAPP14136 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFAPP14136 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFAPP14136 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFAPP14136 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFAPP14136 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFAPP14136 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFAPP14136 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFAPP14136 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GFAPP14136 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFAPP14136 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFAPP14136 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFAPP14136 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFAPP14136 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFAPP14136 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFAPP14136 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFAPP14136 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFAPP14136 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFAPP14136 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFAPP14136 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFAPP14136 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFAPP14136 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFAPP14136 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFAPP14136 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFAPP14136 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFAPP14136 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFAPP14136 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFAPP14136 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFAPP14136 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFAPP14136 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFAPP14136 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFAPP14136 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFAPP14136 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFAPP14136 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFAPP14136 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFAPP14136 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFAPP14136 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFAPP14136 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFAPP14136 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFAPP14136 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFAPP14136 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFAPP14136 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFAPP14136 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms