Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC130P13994 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC130P13994 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms