Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG2P13727 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG2P13727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG2P13727 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG2P13727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG2P13727 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG2P13727 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG2P13727 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG2P13727 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG2P13727 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG2P13727 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG2P13727 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG2P13727 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG2P13727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG2P13727 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG2P13727 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG2P13727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG2P13727 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG2P13727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG2P13727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG2P13727 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG2P13727 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG2P13727 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG2P13727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG2P13727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG2P13727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG2P13727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG2P13727 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG2P13727 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG2P13727 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRG2P13727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG2P13727 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG2P13727 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG2P13727 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG2P13727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG2P13727 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG2P13727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms