Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH1P12830 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH1P12830 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH1P12830 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH1P12830 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH1P12830 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH1P12830 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH1P12830 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH1P12830 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH1P12830 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH1P12830 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH1P12830 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH1P12830 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH1P12830 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH1P12830 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH1P12830 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH1P12830 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH1P12830 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH1P12830 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH1P12830 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH1P12830 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH1P12830 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH1P12830 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH1P12830 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH1P12830 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH1P12830 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH1P12830 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH1P12830 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH1P12830 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH1P12830 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH1P12830 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH1P12830 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH1P12830 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH1P12830 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH1P12830 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH1P12830 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH1P12830 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH1P12830 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH1P12830 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH1P12830 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms