Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN1P12814 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN1P12814 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms