Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFTPCP11686 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPCP11686 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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