Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CETPP11597 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CETPP11597 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CETPP11597 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CETPP11597 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETPP11597 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CETPP11597 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CETPP11597 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CETPP11597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CETPP11597 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CETPP11597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETPP11597 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETPP11597 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETPP11597 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETPP11597 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETPP11597 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CETPP11597 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CETPP11597 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CETPP11597 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CETPP11597 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CETPP11597 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CETPP11597 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CETPP11597 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CETPP11597 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CETPP11597 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CETPP11597 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CETPP11597 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CETPP11597 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETPP11597 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CETPP11597 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CETPP11597 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CETPP11597 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CETPP11597 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CETPP11597 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CETPP11597 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CETPP11597 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CETPP11597 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CETPP11597 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CETPP11597 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CETPP11597 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CETPP11597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETPP11597 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETPP11597 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETPP11597 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETPP11597 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETPP11597 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETPP11597 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETPP11597 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETPP11597 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETPP11597 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETPP11597 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETPP11597 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETPP11597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETPP11597 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETPP11597 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CETPP11597 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CETPP11597 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CETPP11597 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CETPP11597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CETPP11597 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CETPP11597 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CETPP11597 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CETPP11597 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CETPP11597 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CETPP11597 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CETPP11597 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CETPP11597 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CETPP11597 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CETPP11597 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CETPP11597 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CETPP11597 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CETPP11597 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CETPP11597 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETPP11597 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CETPP11597 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CETPP11597 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CETPP11597 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CETPP11597 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CETPP11597 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CETPP11597 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CETPP11597 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms