Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GZMBP10144 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GZMBP10144 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GZMBP10144 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GZMBP10144 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GZMBP10144 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GZMBP10144 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GZMBP10144 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GZMBP10144 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GZMBP10144 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GZMBP10144 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GZMBP10144 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GZMBP10144 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GZMBP10144 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GZMBP10144 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GZMBP10144 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GZMBP10144 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GZMBP10144 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GZMBP10144 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GZMBP10144 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GZMBP10144 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GZMBP10144 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GZMBP10144 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GZMBP10144 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GZMBP10144 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GZMBP10144 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GZMBP10144 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GZMBP10144 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GZMBP10144 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GZMBP10144 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GZMBP10144 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GZMBP10144 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GZMBP10144 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms