Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMIM10L2AP0DMW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM10L2AP0DMW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM10L2AP0DMW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM10L2AP0DMW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms