Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGPD1P0DJD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD1P0DJD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD1P0DJD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
RGPD1P0DJD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.8 ms