Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
C4AP0C0L4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
C4AP0C0L4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
C4AP0C0L4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
C4AP0C0L4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4AP0C0L4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms