Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTAP09496 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTAP09496 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTAP09496 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTAP09496 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTAP09496 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTAP09496 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTAP09496 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTAP09496 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTAP09496 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTAP09496 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTAP09496 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTAP09496 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTAP09496 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTAP09496 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTAP09496 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTAP09496 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTAP09496 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTAP09496 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTAP09496 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTAP09496 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTAP09496 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTAP09496 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTAP09496 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTAP09496 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTAP09496 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTAP09496 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTAP09496 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTAP09496 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTAP09496 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTAP09496 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTAP09496 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTAP09496 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTAP09496 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTAP09496 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTAP09496 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTAP09496 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTAP09496 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTAP09496 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTAP09496 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTAP09496 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms