Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP3P08254 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP3P08254 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP3P08254 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP3P08254 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP3P08254 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP3P08254 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP3P08254 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP3P08254 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP3P08254 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP3P08254 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP3P08254 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP3P08254 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP3P08254 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP3P08254 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP3P08254 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP3P08254 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP3P08254 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP3P08254 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP3P08254 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP3P08254 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP3P08254 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP3P08254 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP3P08254 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP3P08254 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP3P08254 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP3P08254 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP3P08254 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP3P08254 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP3P08254 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP3P08254 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP3P08254 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP3P08254 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP3P08254 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP3P08254 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP3P08254 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP3P08254 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP3P08254 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP3P08254 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP3P08254 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP3P08254 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP3P08254 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP3P08254 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP3P08254 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP3P08254 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP3P08254 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP3P08254 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP3P08254 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms