Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GP1BAP07359 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP1BAP07359 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms