Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLK3P07288 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLK3P07288 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLK3P07288 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLK3P07288 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLK3P07288 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLK3P07288 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLK3P07288 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLK3P07288 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLK3P07288 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLK3P07288 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLK3P07288 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLK3P07288 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLK3P07288 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLK3P07288 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLK3P07288 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLK3P07288 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLK3P07288 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLK3P07288 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLK3P07288 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLK3P07288 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLK3P07288 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLK3P07288 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLK3P07288 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLK3P07288 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLK3P07288 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLK3P07288 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLK3P07288 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLK3P07288 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLK3P07288 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLK3P07288 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLK3P07288 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLK3P07288 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLK3P07288 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLK3P07288 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLK3P07288 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLK3P07288 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLK3P07288 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLK3P07288 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLK3P07288 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLK3P07288 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLK3P07288 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLK3P07288 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLK3P07288 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLK3P07288 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLK3P07288 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLK3P07288 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLK3P07288 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLK3P07288 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms