Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPIND1P05546 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPIND1P05546 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms