Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF2P04141 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF2P04141 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF2P04141 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF2P04141 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF2P04141 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF2P04141 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF2P04141 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF2P04141 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF2P04141 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSF2P04141 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF2P04141 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF2P04141 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF2P04141 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF2P04141 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF2P04141 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF2P04141 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF2P04141 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF2P04141 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF2P04141 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF2P04141 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF2P04141 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF2P04141 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF2P04141 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF2P04141 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF2P04141 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF2P04141 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF2P04141 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF2P04141 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF2P04141 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF2P04141 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF2P04141 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF2P04141 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF2P04141 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF2P04141 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF2P04141 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF2P04141 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms