Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9P02748 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P02748 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9P02748 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9P02748 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9P02748 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P02748 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P02748 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P02748 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P02748 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P02748 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P02748 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P02748 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P02748 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P02748 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P02748 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P02748 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P02748 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P02748 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P02748 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P02748 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P02748 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P02748 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P02748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P02748 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9P02748 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9P02748 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9P02748 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P02748 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P02748 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P02748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P02748 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P02748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P02748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P02748 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P02748 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P02748 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9P02748 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9P02748 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P02748 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9P02748 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9P02748 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9P02748 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9P02748 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9P02748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9P02748 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9P02748 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms