Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGAP02671 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGAP02671 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FGAP02671 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGAP02671 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGAP02671 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGAP02671 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGAP02671 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FGAP02671 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGAP02671 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FGAP02671 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGAP02671 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGAP02671 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGAP02671 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGAP02671 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGAP02671 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGAP02671 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGAP02671 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGAP02671 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGAP02671 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGAP02671 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGAP02671 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGAP02671 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGAP02671 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGAP02671 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGAP02671 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGAP02671 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGAP02671 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGAP02671 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGAP02671 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FGAP02671 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGAP02671 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGAP02671 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGAP02671 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGAP02671 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGAP02671 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGAP02671 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGAP02671 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGAP02671 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FGAP02671 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGAP02671 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGAP02671 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGAP02671 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGAP02671 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGAP02671 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGAP02671 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGAP02671 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGAP02671 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGAP02671 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGAP02671 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGAP02671 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGAP02671 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGAP02671 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGAP02671 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGAP02671 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGAP02671 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGAP02671 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGAP02671 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FGAP02671 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGAP02671 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGAP02671 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGAP02671 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGAP02671 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGAP02671 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGAP02671 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGAP02671 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGAP02671 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGAP02671 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGAP02671 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGAP02671 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGAP02671 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGAP02671 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGAP02671 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms