Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-HP01893 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-HP01893 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms