Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHEP01854 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHEP01854 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHEP01854 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHEP01854 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHEP01854 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHEP01854 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHEP01854 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHEP01854 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHEP01854 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHEP01854 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHEP01854 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHEP01854 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHEP01854 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHEP01854 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHEP01854 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHEP01854 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHEP01854 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHEP01854 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHEP01854 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHEP01854 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHEP01854 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHEP01854 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHEP01854 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHEP01854 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHEP01854 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHEP01854 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHEP01854 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHEP01854 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHEP01854 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHEP01854 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHEP01854 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHEP01854 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHEP01854 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHEP01854 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHEP01854 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHEP01854 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHEP01854 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHEP01854 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHEP01854 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHEP01854 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHEP01854 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHEP01854 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHEP01854 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHEP01854 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHEP01854 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHEP01854 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHEP01854 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHEP01854 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHEP01854 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHEP01854 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHEP01854 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHEP01854 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHEP01854 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHEP01854 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHEP01854 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHEP01854 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHEP01854 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHEP01854 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 907.2 ms