Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1O96005 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms