Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAPLNO95428 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPLNO95428 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPLNO95428 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms