Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIC2O95409 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms