Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB11O95342 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCB11O95342 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms