Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX4O95219 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX4O95219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX4O95219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX4O95219 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX4O95219 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX4O95219 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX4O95219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX4O95219 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX4O95219 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX4O95219 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX4O95219 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX4O95219 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX4O95219 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX4O95219 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX4O95219 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX4O95219 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX4O95219 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX4O95219 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX4O95219 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX4O95219 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX4O95219 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX4O95219 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX4O95219 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX4O95219 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX4O95219 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX4O95219 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX4O95219 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX4O95219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX4O95219 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX4O95219 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX4O95219 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX4O95219 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX4O95219 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX4O95219 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX4O95219 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX4O95219 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX4O95219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX4O95219 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX4O95219 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX4O95219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX4O95219 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX4O95219 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms