Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TRPM2O94759 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRPM2O94759 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRPM2O94759 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRPM2O94759 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms