Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP72O76094 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP72O76094 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP72O76094 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP72O76094 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP72O76094 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP72O76094 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP72O76094 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP72O76094 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP72O76094 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP72O76094 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP72O76094 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP72O76094 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP72O76094 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP72O76094 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP72O76094 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP72O76094 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP72O76094 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP72O76094 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP72O76094 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP72O76094 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP72O76094 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP72O76094 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP72O76094 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP72O76094 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRP72O76094 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP72O76094 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP72O76094 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP72O76094 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP72O76094 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP72O76094 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP72O76094 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP72O76094 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP72O76094 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP72O76094 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP72O76094 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP72O76094 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms