Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNKO75909 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNKO75909 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNKO75909 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNKO75909 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNKO75909 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNKO75909 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNKO75909 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNKO75909 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNKO75909 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNKO75909 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNKO75909 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNKO75909 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNKO75909 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNKO75909 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNKO75909 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNKO75909 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNKO75909 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNKO75909 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNKO75909 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNKO75909 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNKO75909 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNKO75909 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNKO75909 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNKO75909 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNKO75909 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNKO75909 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNKO75909 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNKO75909 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNKO75909 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNKO75909 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNKO75909 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNKO75909 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNKO75909 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNKO75909 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNKO75909 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNKO75909 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNKO75909 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNKO75909 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNKO75909 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNKO75909 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNKO75909 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNKO75909 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNKO75909 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNKO75909 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNKO75909 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNKO75909 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNKO75909 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNKO75909 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms