Protein–RNA interactions for Protein: O75717

WDHD1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDHD1O75717 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDHD1O75717 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDHD1O75717 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
WDHD1O75717 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDHD1O75717 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms