Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCATO75600 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCATO75600 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCATO75600 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCATO75600 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCATO75600 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GCATO75600 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCATO75600 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCATO75600 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCATO75600 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCATO75600 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCATO75600 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCATO75600 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCATO75600 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCATO75600 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCATO75600 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCATO75600 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCATO75600 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCATO75600 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCATO75600 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCATO75600 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCATO75600 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCATO75600 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCATO75600 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCATO75600 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCATO75600 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCATO75600 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCATO75600 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCATO75600 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCATO75600 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCATO75600 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCATO75600 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCATO75600 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCATO75600 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCATO75600 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCATO75600 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCATO75600 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCATO75600 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCATO75600 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCATO75600 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCATO75600 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCATO75600 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCATO75600 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCATO75600 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCATO75600 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCATO75600 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCATO75600 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCATO75600 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCATO75600 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCATO75600 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCATO75600 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCATO75600 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCATO75600 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCATO75600 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCATO75600 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCATO75600 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCATO75600 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCATO75600 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCATO75600 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCATO75600 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCATO75600 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCATO75600 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCATO75600 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCATO75600 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCATO75600 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCATO75600 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCATO75600 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCATO75600 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCATO75600 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCATO75600 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCATO75600 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCATO75600 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms