Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP6O75581 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP6O75581 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP6O75581 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP6O75581 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP6O75581 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP6O75581 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP6O75581 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRP6O75581 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP6O75581 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRP6O75581 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRP6O75581 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP6O75581 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP6O75581 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP6O75581 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP6O75581 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP6O75581 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP6O75581 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRP6O75581 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRP6O75581 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP6O75581 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP6O75581 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP6O75581 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP6O75581 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP6O75581 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRP6O75581 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LRP6O75581 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRP6O75581 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRP6O75581 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP6O75581 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP6O75581 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP6O75581 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP6O75581 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP6O75581 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP6O75581 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP6O75581 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP6O75581 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP6O75581 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP6O75581 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP6O75581 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRP6O75581 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRP6O75581 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRP6O75581 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRP6O75581 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRP6O75581 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRP6O75581 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRP6O75581 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRP6O75581 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRP6O75581 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRP6O75581 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRP6O75581 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
LRP6O75581 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
LRP6O75581 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP6O75581 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP6O75581 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP6O75581 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP6O75581 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP6O75581 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP6O75581 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP6O75581 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRP6O75581 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRP6O75581 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LRP6O75581 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRP6O75581 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRP6O75581 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRP6O75581 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRP6O75581 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRP6O75581 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRP6O75581 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms