Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45BO75293 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45BO75293 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GADD45BO75293 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GADD45BO75293 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GADD45BO75293 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GADD45BO75293 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45BO75293 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45BO75293 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45BO75293 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45BO75293 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45BO75293 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45BO75293 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45BO75293 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45BO75293 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms