Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT3O75175 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms