Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 53
DKC1O60832 DYNC1LI2-212ENST00000568180 573 ntTSL 518.9■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 53
DKC1O60832 DYNC1LI2-210ENST00000566150 568 ntTSL 318.59■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 53
DKC1O60832 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 53
DKC1O60832 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 53
DKC1O60832 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 53
DKC1O60832 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 313.71□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 53
DKC1O60832 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.391e-323■■■■■ 52.9
DKC1O60832 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.067e-11■■■■■ 52.8
DKC1O60832 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 512.49□□□□□ -0.417e-11■■■■■ 52.8
DKC1O60832 ZNF331-219ENST00000513929 1424 ntTSL 220.6■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 52.7
DKC1O60832 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 52.7
DKC1O60832 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.852e-9■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DUSP22-208ENST00000603795 1166 ntTSL 321.67■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DUSP22-212ENST00000604988 503 ntTSL 515.81■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DUSP22-207ENST00000603726 587 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 52.6
DKC1O60832 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 52.6
DKC1O60832 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 52.6
DKC1O60832 HIP1-206ENST00000485723 419 ntTSL 29.65□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 52.6
DKC1O60832 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.722e-22■■■■■ 52.6
DKC1O60832 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.962e-22■■■■■ 52.6
DKC1O60832 MYSM1-207ENST00000493821 7793 ntTSL 1 (best)2.52□□□□□ -2.012e-22■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-42■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-42■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-42■■■■■ 52.6
DKC1O60832 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-42■■■■■ 52.6
DKC1O60832 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 221.08■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 52.5
DKC1O60832 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.949e-7■■■■■ 52.5
DKC1O60832 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 57.13□□□□□ -1.279e-7■■■■■ 52.5
DKC1O60832 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 516.73■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-209ENST00000497336 493 ntTSL 516.14■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-205ENST00000441948 871 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-204ENST00000440085 910 ntTSL 315.05■□□□□ -03e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-202ENST00000416711 708 ntTSL 514.19□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-201ENST00000413668 741 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 SLC38A5-208ENST00000494034 525 ntTSL 511.55□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 52.4
DKC1O60832 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 312.18□□□□□ -0.467e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.617e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.617e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.017e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 55.34□□□□□ -1.557e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 33.88□□□□□ -1.797e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 23.51□□□□□ -1.857e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.617e-17■■■■■ 52.3
DKC1O60832 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 52.3
DKC1O60832 CTR9-202ENST00000524523 902 ntTSL 58.34□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 52.3
DKC1O60832 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.021e-10■■■■■ 52.3
DKC1O60832 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 52.3
DKC1O60832 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 52.3
DKC1O60832 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 52.3
DKC1O60832 TAF1D-213ENST00000529900 1066 ntTSL 23.16□□□□□ -1.91e-323■■■■■ 52.2
DKC1O60832 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.393e-10■■■■■ 52.2
DKC1O60832 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 222.12■■□□□ 1.133e-10■■■■■ 52.2
DKC1O60832 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.113e-10■■■■■ 52.2
DKC1O60832 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 52.1
DKC1O60832 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 52.1
DKC1O60832 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 52.1
DKC1O60832 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-323■■■■■ 52.1
DKC1O60832 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.61□□□□□ -1.831e-323■■■■■ 52.1
DKC1O60832 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.542e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.25e-43■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.052e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 MMAB-205ENST00000537496 1188 ntTSL 220.38■□□□□ 0.855e-43■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-212ENST00000497691 2555 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.172e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.025e-43■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.012e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 413.12□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 52
DKC1O60832 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 58.46□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 51.8
DKC1O60832 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 56.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 51.8
DKC1O60832 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 322.31■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 51.7
DKC1O60832 PAK4-210ENST00000599657 534 ntTSL 421.61■■□□□ 1.058e-7■■■■■ 51.7
DKC1O60832 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 420.83■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 51.7
DKC1O60832 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.798e-7■■■■■ 51.7
DKC1O60832 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 24.33□□□□□ -1.721e-53■■■■■ 51.7
DKC1O60832 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 418.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 51.6
DKC1O60832 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 415.79■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 51.6
DKC1O60832 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 34.01□□□□□ -1.773e-7■■■■■ 51.5
DKC1O60832 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.642e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.72e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.672e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 315.98■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 51.5
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