Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTIPO60759 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTIPO60759 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTIPO60759 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms