Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD1O60671 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD1O60671 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD1O60671 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD1O60671 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD1O60671 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD1O60671 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD1O60671 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD1O60671 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD1O60671 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD1O60671 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD1O60671 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD1O60671 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD1O60671 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD1O60671 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD1O60671 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD1O60671 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD1O60671 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD1O60671 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD1O60671 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD1O60671 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD1O60671 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD1O60671 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD1O60671 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD1O60671 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD1O60671 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD1O60671 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD1O60671 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD1O60671 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD1O60671 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD1O60671 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD1O60671 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD1O60671 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD1O60671 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD1O60671 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD1O60671 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD1O60671 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD1O60671 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD1O60671 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD1O60671 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms