Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PPLO60437 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PPLO60437 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PPLO60437 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PPLO60437 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPLO60437 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPLO60437 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPLO60437 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPLO60437 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPLO60437 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PPLO60437 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PPLO60437 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPLO60437 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPLO60437 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPLO60437 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPLO60437 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPLO60437 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PPLO60437 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PPLO60437 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PPLO60437 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PPLO60437 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PPLO60437 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PPLO60437 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PPLO60437 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PPLO60437 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PPLO60437 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PPLO60437 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PPLO60437 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PPLO60437 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PPLO60437 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PPLO60437 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PPLO60437 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PPLO60437 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PPLO60437 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PPLO60437 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PPLO60437 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PPLO60437 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPLO60437 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PPLO60437 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPLO60437 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPLO60437 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPLO60437 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PPLO60437 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PPLO60437 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PPLO60437 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PPLO60437 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPLO60437 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPLO60437 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPLO60437 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPLO60437 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPLO60437 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPLO60437 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPLO60437 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPLO60437 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPLO60437 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPLO60437 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPLO60437 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPLO60437 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPLO60437 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPLO60437 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPLO60437 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPLO60437 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPLO60437 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPLO60437 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPLO60437 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPLO60437 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPLO60437 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPLO60437 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PPLO60437 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPLO60437 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPLO60437 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPLO60437 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PPLO60437 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPLO60437 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPLO60437 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPLO60437 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPLO60437 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPLO60437 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPLO60437 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPLO60437 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPLO60437 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPLO60437 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPLO60437 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPLO60437 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPLO60437 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPLO60437 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms