Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SPAG9O60271 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SPAG9O60271 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SPAG9O60271 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms