Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB2O43679 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB2O43679 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB2O43679 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB2O43679 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB2O43679 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB2O43679 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB2O43679 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB2O43679 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB2O43679 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB2O43679 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB2O43679 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB2O43679 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB2O43679 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB2O43679 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB2O43679 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB2O43679 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB2O43679 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB2O43679 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB2O43679 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB2O43679 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB2O43679 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB2O43679 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB2O43679 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB2O43679 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB2O43679 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB2O43679 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB2O43679 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB2O43679 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB2O43679 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB2O43679 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB2O43679 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB2O43679 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB2O43679 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB2O43679 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB2O43679 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB2O43679 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB2O43679 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB2O43679 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB2O43679 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB2O43679 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB2O43679 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB2O43679 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB2O43679 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB2O43679 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB2O43679 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB2O43679 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB2O43679 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB2O43679 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB2O43679 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB2O43679 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB2O43679 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB2O43679 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB2O43679 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB2O43679 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB2O43679 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB2O43679 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB2O43679 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB2O43679 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDB2O43679 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB2O43679 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB2O43679 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB2O43679 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB2O43679 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms