Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP2AO43633 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP2AO43633 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP2AO43633 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms