Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZZEF1O43149 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZZEF1O43149 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms