Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEFVO15553 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEFVO15553 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEFVO15553 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEFVO15553 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEFVO15553 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEFVO15553 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MEFVO15553 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEFVO15553 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEFVO15553 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEFVO15553 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEFVO15553 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEFVO15553 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEFVO15553 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEFVO15553 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEFVO15553 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEFVO15553 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEFVO15553 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEFVO15553 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEFVO15553 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEFVO15553 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEFVO15553 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEFVO15553 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEFVO15553 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEFVO15553 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEFVO15553 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEFVO15553 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEFVO15553 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEFVO15553 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEFVO15553 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEFVO15553 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEFVO15553 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEFVO15553 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEFVO15553 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEFVO15553 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEFVO15553 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEFVO15553 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEFVO15553 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MEFVO15553 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEFVO15553 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEFVO15553 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEFVO15553 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEFVO15553 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEFVO15553 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEFVO15553 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEFVO15553 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEFVO15553 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEFVO15553 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEFVO15553 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEFVO15553 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEFVO15553 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEFVO15553 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEFVO15553 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms